Po určité době procesu chlazení vzduchem musí žárově pozinkované ocelové trubky okamžitě projít vodním chlazením. Během ochlazování vzduchem teplota žárově pozinkovaných ocelových trubek pomalu klesá, což umožňuje atomům zinku pokračovat v difúzi směrem k ocelovému substrátu a atomům železa difundovat směrem k vrstvě zinku. Vrstva čistého zinku se tak postupně spotřebovává až do úplného vyčerpání. V tomto okamžiku již není povrch žárově pozinkované ocelové trubky pokryt lesklou vrstvou čistého zinku, ale šedočernou vrstvou slitiny železa a zinku. Aby se dosáhlo jak přiměřeně silné vrstvy slitiny železo-zinek, tak lesklého povrchu vrstvy čistého zinku, je nutné zabránit pokračující difúzi atomů železa a zinku. To je důvod pro okamžité provedení vodního chlazení po specifikované době procesu.
Další výhodou vodního chlazení je zabránění vstupu vysokoteplotních žárově pozinkovaných ocelových trubek do pasivačního řešení a ovlivnění jeho účinnosti. Teplota pasivačního roztoku by neměla překročit přibližně 50 stupňů.
